雌雄异株可以自交，除此之外，雌雄同株、自花传粉、异花传粉都能自交。自交，是指来自同一个体的雌雄配子的结合或具有相同基因型个体间的交配，或来自同一无性繁殖系的个体间的交配。显花植物雌雄同株十分普遍，因此，自交也很普遍。雌雄同花植物的自花授粉或雌雄异花的同株授粉均为自交；动物，由于多为雌雄异体，所以基因型相同的个体间的交配即为自交，其含意较植物要广泛些。

一般来说，一年生植物的自交率比多年生草本植物高，而多年生草本植物又比木本植物的自交率高。从理论上来说，自交率越高，分配在雄性器官上的资源比例可能越低，就越有利于种群的快速增殖。